蓝多多刚完成地球环保任务，正准备返回比特星接受表彰，却收到母星传来的紧急警报来自宇宙深处的黑星舰队，在黑星将军的率领下已锁定地球，企图以“攻略地球”为跳板，夺取比特星的核心环保能量。与此同时，刚晋升为正式船员的哆布哆，驾驶修复好的“布托克号”飞船准备启航，却也探测到黑星舰队的异动。
 
为了守护共同的家园，来自比特星的精灵蓝多多，与外星机器人哆布哆决定联手，联合甄诚、蔡小豆等地球少年组建“星际守护队”。蓝多多用精灵魔法操控自然能量，哆布哆靠外星工具释放机械火力，孩子们则用智慧化解危机。他们不仅要阻止黑星将军攻略地球的阴谋，还要穿越星际防线驰援比特星，最终在一场惊心动魄的星际大战中，彻底击溃黑星舰队。
 
战后，蓝多多选择留在地球继续守护生态，哆布哆则驾驶飞船带着新的使命踏上征程，两个来自不同星球的伙伴，用一场跨越星际的联手，诠释了“守护”与“成长”的真正意义。